输入蛋白质序列
粘贴一条蛋白质序列（单字母氨基酸代码，大小写均可）；空格、数字、下划线自动忽略；以 > 开头的行作为名称行，序列连续的行会拼在一起。B/Z/X 为不定组成残基（含它们的肽段不计算质量）、J 视为 Ile/Leu。
选项
修饰：
质量计算：
修饰只影响肽段质量（与 ExPASy 一致）；蛋白摘要中的质量与等电点按未修饰序列计算。CNBr 会把被切开的 C 端 Met 转成高丝氨酸内酯（HSL）。
酶切结果
输入蛋白质序列后，这里会给出蛋白摘要与酶切肽段表
酶切规则（ExPASy PeptideMass Table 1）
规则与 web.expasy.org/peptide_mass/ 的 PeptideMass 完全一致：C 端 = 该残基之后的肽键，N 端 = 该残基之前的肽键。
氨基酸残基质量表
残基质量 = 游离氨基酸 − H2O（肽键内形式）；整肽中性质量 = N 端 H + Σ残基 + C 端 OH。数据取自本站 MassCalc 同一份 NIST 数据集。
本工具可选的修饰质量
半胱氨酸与甲硫氨酸修饰按全局选项套用到所有肽段（与 ExPASy 相同）；质量增量由加成化学式按元素表计算。