← 返回科研导航

GRAVYCalc 蛋白疏水性计算

FASTA 多序列 · Kyte-Doolittle 疏水值 · 批量 GRAVY

English 简体 繁體

输入 FASTA 蛋白序列

粘贴 FASTA 格式序列：> 开头的行为头行，多条序列必须各自有头行；单条序列可不写头行。也可以把 .fasta / .txt / .gz 文件拖进输入框。

选项

显示序列：
这些字符不计入长度也不参与平均（如终止符 * 、比对空位 -）；其余非标准字符会标记为警告。
小数点符号：

结果

Kyte-Doolittle 氨基酸疏水值

疏水值取自 Kyte & Doolittle, J. Mol. Biol. 157 (1982) 105-132 表 1：正值疏水（倾向膜内），负值亲水（倾向溶剂）。GRAVY = 序列内全部氨基酸疏水值之和 ÷ 氨基酸个数。

这是什么工具

GRAVYCalc 计算蛋白序列的疏水平均值（GRAVY，grand average of hydropathy）：把序列里每个氨基酸的 Kyte-Doolittle 疏水值加起来，除以氨基酸个数。GRAVY 是判断蛋白倾向的最常用单一指标——跨膜蛋白 富含 I、L、V、F、M，GRAVY 通常明显为正；可溶性球蛋白与核内蛋白 GRAVY 多为负。它对标 gravy-calculator.de，输入格式、忽略字符、导出分隔符与小数点选项都与原站一致。

所有计算都在你自己的浏览器里完成：疏水值表随页面一起下载，没有后端、不上传任何序列。当前输入存在浏览器本地，刷新还在；序列再长也只是逐字符一次加法，毫秒级完成。

功能

怎么用

  1. 把 FASTA 序列粘进输入框（多条序列每条都要有 > 头行），或点「从文件导入…」/ 直接拖文件进来。
  2. 需要跳过终止符或空位就把字符填进「忽略字符」；想核对序列就打开「显示序列」。
  3. 表格实时给出每条记录的长度与 GRAVY；非标准字符会在警告列逐字符计数。
  4. 选好分隔符与小数点，点「复制结果」或「下载文件」把整张表带走。

常见问题

GRAVY 是什么？怎么读这个数？
GRAVY = Σ(氨基酸疏水值) ÷ 序列长度，疏水值用 Kyte & Doolittle (1982) 标度（I 4.5 最高，R -4.5 最低）。整体为正说明序列整体疏水，常见于跨膜蛋白（多数 > 0，强跨膜可达 1 以上）；为负说明偏亲水，常见于可溶性蛋白。它只是整体平均——一段亲水一段疏水的序列平均值可能接近 0，判断膜蛋白请结合跨膜区预测。
序列里的 X、B、Z、U、*、- 怎么处理？
不在 20 种标准氨基酸里的字符分两类：填进「忽略字符」的不计数（默认 * 和 -，可自行增删）；没填的按字符计数标成警告列，长度只统计标准氨基酸。想连模糊码一起忽略，把 X 等字符加进忽略框即可。
序列会上传吗？
不会。页面纯静态、无后端接口，计算在浏览器本地完成；输入只写进浏览器本地存储，清空或换浏览器即消失。未发表序列也可以放心算。
数字编号和空格要删掉吗？
不用。序列行里的空白与数字（比如从 PDF 复制出来的行号）会自动丢弃，只统计字母；头行内容原样保留作为结果表里的名称。
导出的文件是什么格式？
纯文本表格，四列：编号、名称/描述、长度、GRAVY。选制表符可直接贴进 Excel；选逗号得到 .csv；小数点符号可切换为逗号，适配欧洲区域设置。

站内其他工具

纯前端实现 · 零依赖 · 免费 · 支持中/繁/英