MassCalc 分子式与质谱计算

支持 C6H12O6、Ca(OH)2、CuSO4·5H2O、[13C]6H12O6、SO42-；离子式写 [M+H]+、[M+2H]2+、[2M+H]+、M-e。

给定精确质量（或 m/z + 电离式）与容限，枚举所有满足元素上下限的候选分子式，并按氮规则、RDBeq、同位素峰表相似度排序。

按 NIST 天然丰度逐元素展开多项式再卷积，得到 M、M+1、M+2 … 各峰的相对强度；可叠加高斯展宽模拟仪器峰形。输入可以是分子式，也可以是氨基酸组成（A3R2K1，含两端基团）；选好后电荷 z，峰表按 m/z 刻度给出每一根峰，卡片同时给单同位素 m/z 与平均 m/z。

输入母体分子式，列出可行的中性丢失（原子够不够、丢完剩什么式、质量差多少），并可检索常用碎片基团与加合离子表。

序列支持单字母（PEPTIDE）、三字母（ALA-GLY-…）、修饰写法（P(Phos)、[Cit+71.984]）与末端（-NH2）。碎片表按 a/b/c、x/y/z 系列与互补自洽关系给出，每行同时列单同位素 m/z 与平均 m/z。输入方式切到「氨基酸组成」时只填各残基个数（如 A3R2K1），算整肽分子式、质量与加合离子的平均 m/z；组成没有顺序，所以不出碎片与酶切表。

单体取核苷酸单磷酸（dA 331.068 / dC 307.057 / dG 347.063 / dT 322.057 / dU 308.031），缩合失水成链；5′/3′ 端可选羟基或磷酸。碎片按磷酸二酯骨架四个可断键位定义，同一位点两侧相加等于母链。

端基 + Σ(重复单元 × 个数) + 电离式，枚举每个 n 的分子式、单同位素/平均质量与 m/z；相邻 n 的质量差就是重复单元质量。

数据取自 NIST《Atomic Weights and Isotopic Compositions》快照，丰度已按元素归一；标准原子量带区间的是 IUPAC 区间断点写法。

按名称、分子式或标签检索；点「去计算」把分子式送进分子式分区，直接看加合离子与同位素分布。