← 返回科研导航

肽段质量、氨基酸组成、酶切与碎片表

序列或氨基酸组成 · a/b/c 与 x/y/z 碎片 · 酶切产物 · 平均 m/z

English 简体 繁體

肽段质量、氨基酸组成、酶切与碎片表

序列支持单字母(PEPTIDE)、三字母(ALA-GLY-…)、修饰写法(P(Phos)、[Cit+71.984])与末端(-NH2)。碎片表按 a/b/c、x/y/z 系列与互补自洽关系给出,每行同时列单同位素 m/z 与平均 m/z。输入方式切到「氨基酸组成」时只填各残基个数(如 A3R2K1),算整肽分子式、质量与加合离子的平均 m/z;组成没有顺序,所以不出碎片与酶切表。

序列支持单字母(PEPTIDE)、三字母(ALA-GLY-…)、修饰写法(P(Phos)、[Cit+71.984])与末端(-NH2)。碎片表按 a/b/c、x/y/z 系列与互补自洽关系给出,每行同时列单同位素 m/z 与平均 m/z。输入方式切到「氨基酸组成」时只填各残基个数(如 A3R2K1),算整肽分子式、质量与加合离子的平均 m/z;组成没有顺序,所以不出碎片与酶切表。

全部计算都在你的浏览器本地完成,输入的任何内容都不会上传。

打开这个计算器

肽段分区收两种输入:完整序列(单字母 PEPTIDEKRAQ、三字母 ALA-GLY-…、带修饰的 P(Phos) 或 [Cit+71.984])和只有组成的写法(A3R2K1)。两种都会给出整肽分子式、单同位素与平均质量,以及各加合离子的 m/z——平均 m/z 尤其适合对照低分辨或宽包络仪器上的观测值。

序列输入还会展开碎片表:a/b/c 与 x/y/z 系列、次级离子(b-H2O、y-NH3 等)与多价电荷,每行同时列单同位素 m/z 与平均 m/z,互补碎片相加等于母体;并按酶(胰蛋白酶、Lys-C、Glu-C、Asp-N 等)给出酶切产物列表,可设漏切数与长度范围。组成输入没有顺序,所以只算整肽,不出碎片与酶切表。

怎么用

  1. 选输入方式:序列,或氨基酸组成。
  2. 序列写法直接敲 PEPTIDEKRAQ;修饰写在残基后的括号里,如 P(Phos)、M(Ox)。
  3. 组成写法在「氨基酸组成」里填各残基个数,并选 N 端 / C 端基团。
  4. 勾选需要的碎片系列与电荷,表格可整段复制;酶切列表按酶与漏切数生成。

常见问题

三字母序列和带修饰的写法怎么输入?
三字母用连字符连接,如 ALA-GLY-SER;修饰紧跟在残基后面写成括号,例如 P(Phos) 表示磷酸化;也可以直接写质量增量,如 [Cit+71.984],或用 -18 表示脱水。
为什么氨基酸组成没有碎片表?
组成不含顺序信息:同一个组成可以对应许多不同序列,断裂位置无法确定。所以组成输入只给整肽质量与加合离子 m/z,要碎片表请改用序列输入。
平均 m/z 什么时候更可信?
低分辨仪器或同位素包络很宽的肽(含多个 Br/Cl、碳数很多)上,观测峰位更接近平均质量换算的 m/z;对照平均 m/z 判断往往比只用单同位素质量稳。
输入的内容会上传吗?
不会。页面没有后端:算法、NIST 同位素数据与各词典都随页面一起下载,全部计算在浏览器本地完成。
数据准吗?
同位素质量与丰度取自 NIST 快照(94 种元素、298 个同位素),同位素分布是精确的多项式卷积,与主流模拟器在小数点后几位一致。
免费吗?要注册吗?
免费、无使用次数限制,也不用注册或登录。
能把计算发给别人吗?
可以。点「复制链接」,输入状态会编进网址哈希,对方打开就是你看到的这套结果。

MassCalc 的其他分区

站内其他工具

纯前端实现 · 零依赖 · 免费 · 支持中/繁/英