MassCalc 分子式與質譜計算

支持 C6H12O6、Ca(OH)2、CuSO4·5H2O、[13C]6H12O6、SO42-；離子式寫 [M+H]+、[M+2H]2+、[2M+H]+、M-e。

給定精確質量（或 m/z + 電離式）與容限，枚舉所有滿足元素上下限的候選分子式，並按氮規則、RDBeq、同位素峰表相似度排序。

按 NIST 天然豐度逐元素展開多項式再卷積，得到 M、M+1、M+2 … 各峰的相對強度；可疊加高斯展寬模擬儀器峰形。輸入可以是分子式，也可以是氨基酸組成（A3R2K1，含兩端基團）；選好後電荷 z，峰表按 m/z 刻度給出每一根峰，卡片同時給單同位素 m/z 與平均 m/z。

輸入母體分子式，列出可行的中性丟失（原子夠不夠、丟完剩什麼式、質量差多少），並可檢索常用碎片基團與加合離子表。

序列支持單字母（PEPTIDE）、三字母（ALA-GLY-…）、修飾寫法（P(Phos)、[Cit+71.984]）與末端（-NH2）。碎片表按 a/b/c、x/y/z 系列與互補自洽關係給出，每行同時列單同位素 m/z 與平均 m/z。輸入方式切到「氨基酸組成」時只填各殘基個數（如 A3R2K1），算整肽分子式、質量與加合離子的平均 m/z；組成沒有順序，所以不出碎片與酶切表。

單體取核苷酸單磷酸（dA 331.068 / dC 307.057 / dG 347.063 / dT 322.057 / dU 308.031），縮合失水成鏈；5′/3′ 端可選羥基或磷酸。碎片按磷酸二酯骨架四個可斷鍵位定義，同一位點兩側相加等於母鏈。

端基 + Σ(重複單元 × 個數) + 電離式，枚舉每個 n 的分子式、單同位素/平均質量與 m/z；相鄰 n 的質量差就是重複單元質量。

數據取自 NIST《Atomic Weights and Isotopic Compositions》快照，豐度已按元素歸一；標準原子量帶區間的是 IUPAC 區間斷點寫法。

按名稱、分子式或標籤檢索；點「去計算」把分子式送進分子式分區，直接看加合離子與同位素分布。