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数据分析

数据分析板块覆盖从「取数据」到「出结论」的整条链路,分生信分析、数据与计算、科研工具、生物学数据库、化学数据库与计算工具六组。生物学数据库一组从蛋白到通路成体系:序列与功能注释查 UniProt 和 Gene Ontology,三维结构查 RCSB PDB,蛋白表达定位看人类蛋白质图谱,通路分析用 KEGG 与 Reactome,基因列表批量富集交给 Metascape,质谱原始数据的提交与检索走 ProteomeXchange 与 PRIDE,EMBL-EBI 是这些资源的总站门户。生信分析一组是分析动作本身:NCBI 与 BLAST 处理序列,Ensembl 与 UCSC Genome Browser 看基因组,STRING、GEPIA、GeneCards 查互作与表达,DAVID 与 Enrichr 做富集,cBioPortal 做癌症组学看板,方法与脚本问题去 Biostars 搜索,多数已有现成答案。数据与计算一组覆盖通用计算与公共数据集:Wolfram Alpha 与 GeoGebra 处理公式与图形,Kaggle、Google 数据集、Data Commons、Our World in Data 与国家统计局提供数据源,ScienceDB 可为中文科学数据申请 DOI。科研工具一组处理文献本身:Zotero 管参考文献,Overleaf 写公式,Elicit、Consensus、Connected Papers、Research Rabbit 做文献综述与关联图谱。化学数据库以 PubChem 查结构与理化性质。计算工具一组是实验台边最常打开的小工具:疏水值、肽段质量、碎片离子、凝胶配制各司其职,医学公式另配 MDCalc。检索数据库建议先用编号(accession / PDB ID)直查,比关键词更准也更省事。