科學數據庫

科學數據庫板塊按「數據」與「工具」分層組織。生物學數據庫一組從蛋白到通路成體系：序列與功能註釋查 UniProt 和 Gene Ontology，三維結構查 RCSB PDB，蛋白表達定位看人類蛋白質圖譜，通路分析用 KEGG 與 Reactome，基因列表批量富集交給 Metascape，質譜原始數據的提交與檢索走 ProteomeXchange 與 PRIDE —— 期刊要求公開數據時從這兩個入口進，EMBL-EBI 則是這些資源的總站門戶。化學數據庫一組以化學計算爲主：ChemCalc 解析化學式並算分子量，NIST 的糖鏈質量計算器配合質譜數據使用。計算工具一組是實驗台邊最常打開的小工具：疏水值、肽段質量、碎片離子、凝膠配制各司其職，醫學公式另配 MDCalc。檢索數據庫建議先用編號（accession / PDB ID）直查，比關鍵詞更準；給計算工具喂序列時注意端基與修飾設置，結果才有意義。